春节游黄山
对于春节出游的计划规划了有几年,之前因为疫情,基本都窝在家。今年跟老婆商量了就去黄山。
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近期领导对预测抗体免疫原性比较上心,最近看了不少文献同时也用了不少软件来预测抗体免疫原性。今天看刚好看到一篇综述,是欧洲免疫原性平台(EIP)的非临床免疫原性风险评估小组对目前使用的assay以及方法进行了回顾,这篇文章比较系统,对方法介绍的比较详细,就把文章整理了一下。吐槽一句,这哥们写的文章里面到处都是长难句。只能意会难以言传,建议去阅读原文。
今天王大厨说要给我做意面,我表示很期待。虽说王大厨平时比较少下厨房,但是厨艺很是不错,特别是意面。
对抗体序列进行编号,可以用来识别不同抗体上的相同位点。此外对抗体序列的注释也有利于对抗体序列进行比对、分析、抗体结构建模和改造等等。目前对抗体进行注释的方法有很多,各种方法的原理也不尽相同,因此了解每种方法背后的原理也能够让自己在做抗体改造的时候选择最合适的编号方式。
抗体的可变区部分是由多个基因组成,包括V基因、D基因和J基因。分析抗体序列的时候不仅需要鉴别出各个基因的来源也需要比较与胚系基因的差别。常用的软件包括igblast。igblast可以检索到最匹配的V、D、J胚系基因,同时也能够分析出基因重排的细节。igblast能够分析核酸序列以及氨基酸序列。但是由于网站位于国外,所以经常会遇到网络卡顿或者访问被禁的情况,这边我介绍下如何架设本地的igblast。